生化妊娠”是指胚胎已经着床，胚胎滋养细胞分泌的β-HCG已进入母体血液，并达到可在尿或血中检测出的水平，但是之后由于某种原因，胚胎没能持续生长就枯萎了，血中的β-HCG也随之下降。之所以称为“生化妊娠”，是因为虽然生物手段可以检测到怀孕(例如验孕纸)，但是B超还不能检测出孕囊。
与自然妊娠一样，试管婴儿发生生化妊娠的原因也包括以下这些：
1、受精卵本身有缺陷
胚胎染色体异常被认为是生化妊娠的主要原因。怀孕前三个月早期流畅案例中，有超过50%的流产原因是染色体异常。除非是胚胎植入前先筛选好优质的卵子和精子染色体(俗称第三代试管)，否则常规的试管婴儿技术并不能鉴别染色体异常。
2、疾病病毒
女性怀孕前后体内出现感染，高热、病毒、败血症等感染，会对卵子和受精卵造成影响，除了影响发育甚至还有可能导致流产。所以增加身体素质十分重要吧?
3、卵巢黄体功能不全
黄体不好，导致黄体酮分泌不足，子宫内膜异常，影响受精卵在子宫内的着床。由于个体吸收差异，在试管婴儿中黄体对每个准妈妈是否都是剂量适中是不确定的。
4、子宫因素
子宫环境是胚胎着床的重要基础。子宫发育不良、子宫内膜菲薄，子宫粘膜下肌瘤、子宫内膜息肉、宫腔粘连、子宫内膜结核等影响着受精卵的着床。在移植之前发现子宫环境不好，一定要加强调理才能为着床创造最有利的条件。
5、外界因素影响
外界环境通常比我们想象的更重要。吸烟(包括吸二手烟)、饮酒、接触化学性毒物、严重的噪声和震动、情绪异常激动、高温环境等，可导致胎盘和胎儿损伤，造成流产。移植的准妈们记住了吗?
6、一次不知场所的胚胎着床
偶发的生化妊娠多为胚胎本身质量不好，或者偶然因素导致受精卵染色体变异，被优胜劣汰被自然淘汰。人类胚胎也遵循着“适者生存”这个规律，大约有70%的胚胎会被最终自然淘汰，生化妊娠后妊娠的丢失率约30%。
“生化”妊娠是有迹可循的，正常情况下在排卵12天后，早孕试纸就可以测出弱阳性，有部分患者是隔天试纸颜色加深,还有部分是每天都有明显加深，如果连续3天以上没有任何加深的趋势，这个胚胎一般都有问题。这时需要去医院做检查，观察B超是否能看到宫内孕囊。如果观察不到，基本可以确认是“生化”妊娠。“生化”妊娠在试管婴儿过程中更容易发现。