鼠型斑疹伤寒潜伏期为1～2周临床表现和流行性斑疹伤寒相似，但病情轻病程短急性起病。出现发热，头痛，恶心，呕吐。患者神经系统症状。较流行性斑疹伤寒轻，表现为头痛，头晕，失眠，较少发生烦躁谵妄昏睡及意识障碍约50%可伴有脾轻度肿大，肝肿大，较少见本病预后良好多在发病第2周恢复。但老年患者或未经治疗患者感染后可陷于极度衰弱恢复期延长。
鼠型斑疹伤寒起病多急骤，少数患者有1～2天的乏力，纳差及头痛等前驱期症状体温逐渐上升。第1周末达高峰多在39℃左右稽留热或弛张热热程多为9～14天，体温多逐渐恢复正常伴发冷头痛全身痛及结膜充血。
中枢神经系统症状，患者神经系统症状较流行性斑疹伤寒轻表现为头痛，头晕，失眠，较少发生烦躁谵妄昏睡，及意识障碍约50%。可伴有脾轻度肿大，肝肿大较少见。50%～80%的患者在发病第5天开始出现皮疹，初为红色斑疹直径约1～4mm继成暗红色斑丘疹，压之退色极少为出血性。常初发于胸腹部于24h内迅速扩展至颈背肩臂下肢等处颜面及掌跖部少见。近年来国内报道出现皮疹者不足10%，皮疹出现时间及特点与流行性斑疹伤寒相似但皮疹数量少多为充血性出血性皮疹极少见。