CT和MRI已公认为诊断脑积水的可靠手段，它们均为非创伤性，较传统的脑室造影更为直观，并且能较好地明确脑积水的病因、分类和区别其他原因的脑室扩大。就CT和MRI比较，则MRI更为优越，它可进行高分辨力的冠状面、矢状面和横断面扫描，尤其是对后颅凹，由于矢状面扫描可更好地显示中脑导水管，又无颅骨伪影之虑。
MRI被确定为检查儿童脑脑积水的最佳方法
CT成像相比MRI有一定的缺陷和风险。比如，检查儿童脑积水，可能会给儿童带来与成年人一样的辐射相关的癌症风险。MRI有效避免CT带来的患癌风险。
对于那些不服从指挥的儿童，尤其是非常小的孩子们，快速脑磁共振可以在20秒内迅速有效的做出评估，而且不需要镇静剂。
核磁共振成像检查注意事项：
1、检查前须取下一切含金属的物品，如金属手表、眼镜、项链、义齿、义眼、钮扣、皮带、助听器等；
2、装有心脏起搏器的患者禁止做MRI检查；
3、做盆腔部位检查时，需要膀胱充盈，检查前不得解小便。有金属节育环者须取出才能进行；
4、体内有弹片残留者，一般不能做MRI;
5、手术后留有金属银夹的病人，是否能做MRI检查要医生慎重决定；
6、胸腹部检查时，要保持呼吸平稳，切忌检查期间咳嗽或进行吞咽动作；
7、MRI对饮食、药物没有特别要求；
8、检查时要带上已做过的其他检查材料，如B超、X线、CT的报告。