不管是新生儿甲减，还是老年人的甲减，还是孕妇的甲减，都需要甲状腺素片替代治疗，但是新生儿的甲减一定要区分。她到底是真的甲减还是假的甲减，胎儿甲状腺功能可能受母体的影响，有一定的遗传影响。新生儿出生之后要查足跟血，要查她的甲状腺素水平。如果不正常的情况下，在一个月之后可以复查。
所以我们首先要分清新生儿是不是甲减，因为我们说婴幼儿在2岁之内，她的甲状腺轴并没有发育完全，她的促甲状腺素TSH的水平是可以增加的，所以TSH水平增加，不见得这个胎儿或者这个小孩，或者这个婴儿就一定有甲减。新生儿在甲状腺轴不稳定的情况下不一定是甲减。
如果是真正的甲减，再用甲状腺素片替代治疗，如果是由于实验误差或者是甲状腺轴不稳定造成的，TSH水平的增加，我们可以观察间断的进行复查，可以不用吃药，只要胎儿没有厌食、不想吃东西、不闹、老比较呆滞、反应不灵敏，不出现这些症状，这些就不是甲减的症状。
新生儿甲状腺激素分泌不足引起甲减主要有两个原因：一是母亲的原因。母体甲状腺功能不全，多是由碘缺乏引起，也有部分原因是母亲在妊娠期间摄取了大剂量碘剂、大剂量的抗甲状腺药物或放射性同位素碘所致，其次是母亲患自身免疫甲状腺炎(特别是桥本甲状腺炎)会使甲状腺激素供给不足。二是幼儿自身的原因，即先天性甲状腺发育不全。
先天性甲减患儿常常在6个月以后出现典型症状，随着孩子逐渐长大症状也越来越明显，这时父母往往才注意到孩子的异常。发育落后，如不爱活动，坐立行走及语言均发育迟缓，第二性征发育延迟。智力发育迟缓，神经反射迟钝，甲减的症状是言语缓慢，发音不清，声音低哑，多睡多动。甲减的症状表情呆滞，视力、听力、嗅觉及味觉迟钝。有幻觉、妄想，抑郁、木僵，昏睡，严重者可精神失常。
先天性甲减对新生儿的影响将是一生的，如果不及时治疗，将对孩子一生造成不可弥补的伤害。所以，对新生儿进行甲减筛查是非常重要的，新生儿甲减的筛查，应在新生儿出生后不久就可以诊断甲减症，并在几天内就可以得到治疗。治疗越早越好。超过3个月则效果很差。