与自然妊娠一样，试管婴儿发生生化妊娠的原因也包括以下这些：
1、受精卵本身有缺陷：一般来说，胚胎染色体异常可能是导致生化妊娠的主要原因。在怀孕前三个月的早期流产中，有超过50%的流产原因是染色体异常。除非是第三代试管技术，否则常规的试管婴儿技术并不能从外观上鉴别染色体有没有异常。
2、卵巢黄体功能不全：黄体功能不好，会导致黄体酮分泌不足，子宫内膜异常，影响受精卵在子宫内的着床。虽说试管婴儿有常规黄体支持，但由于药物剂量、药物吸收等个体差异，无法100%保证妊娠结局。
3、子宫因素：子宫发育不良、子宫内膜薄、子宫粘膜下肌瘤、子宫内膜息肉、宫腔粘连、子宫内膜炎、子宫内膜结核、输卵管积液等因素，都影响着受精卵的着床。所以，做试管前最好把这些子宫异常因素都处理好（尤其是胚胎移植前），尽量为胚胎提供一个理想的“温床”。
4、免疫因素和易栓症：精子、精浆或受精卵是抗原物质，被阴道及子宫上皮吸收后，通过免疫反应产生抗体物质，使精子与卵子不能结合或受精卵不能着床。血液高凝状态（也称易栓症）造成局部血液供应不足。
5、外界因素：吸烟（包括吸二手烟）、饮酒、接触化学性毒物、严重的噪声和震动、情绪异常激动、高温环境等，都可导致胎盘和胎儿损伤，造成流产。
6、疾病病毒：女性朋友怀孕前后出现高热、病毒、败血症等感染，会对卵子和受精卵的发育产生影响，造成流产。所以，建议孕前进行必要的体育你懂，增强一下身体素质。
试管技术直接把胚胎移植到子宫吗？为何也会宫外孕？
试管婴儿虽然是通过人工方式，直接将胚胎植入子宫，但胚胎在着床扎根前，还是在宫腔内游走的，有时也会游出宫腔，误入输卵管，导致宫外孕。试管婴儿周期宫外孕的发生率为2%～5%，稍高于自然妊娠，有解释认为这与促排卵周期雌、孕激素水平的升高，导致输卵管功能异常有关。此外，胚胎移植时放入宫腔的位置、子宫肌层异常蠕动或做试管的女性本身输卵管就存在异常，也都可能导致宫外孕的发生。
为了避免宫外孕，你要做到这些：
1、科学避孕，避免反复人流，减少宫腔内操作
2、注意性生活卫生，减少盆腔炎、输卵管炎症的发生
3、孕前及时治疗阴道炎、盆腔炎等妇科疾病
4、孕早期做好相关检查
深圳中山泌外生殖提醒：进化论告诉我们“物竞天择，适者生存”，而人类胚胎当然也遵循着这个规律——大概有70%的胚胎最终会被自然淘汰，而生化妊娠后的妊娠丢失率约为30%（不包括临床妊娠流产）。所以啊，偶然一次生化妊娠不必太紧张，它可能只是一场优胜劣汰，下次继续移植就好。